清光绪二十四年（1898年）11月5日，邓均吾出生于泸州市古蔺县龙山镇。
清光绪三十年（1904年），邓均吾入其祖父的私塾读书，接触四书五经和古典诗词。
清宣统元年（1909年），邓均吾岁父亲到河北上学，仍受正统儒家教育，但开始接触一些新书刊。
辛亥革命后，邓均吾全家自河北返回四川。
民国元年（1912年），邓均吾考入重庆广益中学。
民国五年（1916年），就读于重庆广益中学，酷爱新旧诗词，结识吴方吉，交往甚密。
民国九年（1920年），邓均吾离家远行，从重庆沿江东下上海，寻求人生的新理想。
民国十年（1921年）4月，在上海泰东书局编辑所工作，海结识了郭沫若和成仿吾。同年冬天，邓均吾参加创造社，是创造社在国内发展的首批社员之一。
民国十一年（1922年），与林如稷等组织浅草社，创办《浅草》文艺季刊。
民国十一年（1922年）下半年起，邓均吾和郭沫若、成仿吾、郁达夫一起编辑《创造季刊》。
民国十二年（1923年）同郁达夫、成仿吾主办《中华新报》副刊。
邓均吾在“泰东”没有固定工资，仅靠编稿等不固定收人维持生计。民国十三年（1924年），浅草社的林如稷、陈翔鹤先后离去，《创造日》、《创造季刊》、《创造周报》皆相继停刊。创造社前期活动趋于停止。同年夏天，邓均吾六旬老母邱氏正在病中，他便离沪返川。
邓均吾自民国十三年（1924年）下半年返川至民国二十一年（1932年）上半年，相继在湘西川军陈渠珍部任书记，在古蔺县立小学任教，在北碚温泉工作，在重庆联中和广益中学执教，为生计东奔西走，很为苦闷。
民国十六年（1927年）“三·三一”惨案和“四·一二”政变，使他看到反动派的面目，他在痛苦中探求人生道路，开始学习马列主义和介绍苏联国情的书刊，逐步接受科学社会主义思想。这个时期，他的文学活动不多，创作新旧体诗词《乌江道中》、《野菊花》、《友谊》、《青山潍，翻译了莎士比亚的《十四行诗》。
民国二十一年（1932年），经友人介绍再次赴沪，在杨伯凯、任白戈、沙汀等积资创办的辛垦书店译书，预支稿费维持生活。他翻译了英国著名科学家汤姆生的《科学概论》，被恩格斯称赞的英国著名哲学家约翰·洛克的《人类悟性论》，均由辛垦书店出版。
民国二十二年（1933年）底，邓均吾再度回川。
民国二十三年（1934年）至民国二十五年（1936年），邓均吾积极倡导兴办古蔺县立中学，并出任教务主任、校长。中国工农红军长征路过古蔺时，他支持学生参加红军。
民国二十六年（1937年）秋，邓均吾到成都，在《大声周刊》社工作。
1938年初，参加中华文艺界抗敌协会成都分会，被选为分会理事，任研究部负责人和《笔阵》编委，在党的直接领导下，团结进步文艺工作者，开展抗日救亡工作。
民国二十七年（1938年）夏，邓均吾常与车耀先及党员作家周文、沙汀、赵其文等往返，在他们的帮助下，在抗日救亡运动的锻炼中，邓均吾于1938年加入中国共产党，进行革命活动。
民国二十八年（1939年）秋，邓均吾因老母病故，返回故里。按照党组织的委派，从1939年秋至1941年春，任中共地下党古蔺县委书记，以教育职业为掩护，对该县地下党组织的思想建设、组织建设，以及该县开展抗日救亡，统一战线工作皆有较大贡献。
民国三十年（1941年）春皖南事变后，邓均吾按照上级指示，撤离古蔺，利用同乡关系随赴彭水县任县长的朱彦林在县政府任秘书。他在彭水县立足后，协助上级转移隐蔽党员，并协助在该县建立特别支部。
民国三十一年（1942年）春，邓均吾按照党的安排再返古蔺。
民国三十二年（1943年），邓均吾任古蔺县教育科长；利用中学校长及县参议员的公开身份开展合法斗争，掩护地下党的秘密活动达四年之久。后因有‘戴红帽子”之嫌，被当局撤去校长职务，旋到北碚、金堂等地中学任教。
民国三十六年（1947年）冬，邓均吾又随同乡朱彦林宦营山县长之便，任营山晋德中学教席，兼县政府秘书，他利用县政府秘书工作搞情报工作，在危急关头多次保护了组织和同志。
1949年3月，邓均吾到重庆，经民主人士柯尧仿介绍在参议会任秘书。此时他失掉了党的组织关系，仍积极参加党领导下的革命活动，联系民主人士。
重庆解放后，邓均吾全力投入人民政权建设和统一战线工作。
1949年后，邓均吾任重庆市文联副主席，重庆市文史研究馆馆长。
20世纪50-60年代，邓均吾历任重庆市文联秘书长、副主席、中国作协理事、《奔腾》和《红岩》主编，并长期兼任重庆文史馆馆长。
在“文化大革命’的浩劫中，邓均吾遭到“四人帮”的迫害，他的许多诗词，被颠倒是非的随意阉割、曲解，打成“反诗”、“毒草”。邓均吾虽横遭迫害，但对党一片忠心，对前途仍充满希望。他告慰好友：‘请君放眼量风物，环宇同温会有时”（《酷热中答人问讯》）、“时间催物化，万古不曾停，～。”（《暮春》）。
1969年9月3日，邓均吾受文革迫害，因病逝世于重庆，享年71岁。
1979年2月，中共重庆市委在市政协礼堂为邓均吾举行追悼会，并予以昭雪平反。